他生于清光绪十九年（1893年）乳名云祯，学名世德，字志明，号唯一。他家道贫寒，其父出生三天后，祖父便辞别人世，遗下寡母孤儿，靠帮人挑担挣取血汗钱来养育孤子。后来其父与同村的堂兄泰舟在伦头铺开庆记店同做柴炭业。略有积蓄，便往佛山经商，开成昌炭行。稍有积蓄，立志以教育投资，供世德入学。而世德秉性贤良、好静，且自幼聪颖好学，因家境穷困，使他练就了艰苦奋进的个性品格。在村里读私塾两年，以后，就转到广宁县城文治书院就读，毕业后考上广东省肇庆府公立广肇罗甲种农业学校攻读，三年后，1910年毕业后赴广州考上了中法韬美医学院深造。入学初，他首先碰到的难题就是语言不通。院里的教授大多数是讲外语，课程全是外文，既听不懂，又不会读，更不会讲，成了攻读医学的最大障碍。但他没有被困难吓到，采取“早起、晚睡、午不休”的办法刻苦学习，每天清早读字母、正形口音，中午练写外文，晚上做作业、抄笔记、反复练习。这些举动，引起了该院德国籍的马丁院长的注意，破格做他的外语辅导老师，每晚抽空为他补习德语及拉丁文。这样，很快攻破了外语这个难关。他掌握了外语这一语言工具以后，像脱了缰的骏马那样在知识海洋里奔驰，除了在课堂上学好基本功课掌握基础知识以外，总是足不出院门，时常到图书馆里埋头阅读各种医学名著，特别对外科手术书籍更是如饥似渴地翻阅、研究、摘抄、做笔记，吸取丰富的精神营养。
1914年，他在医学院里实习，在教授、医师的“传、帮、带”下，坐诊、看病、开药、做外科手术，很快掌握基本规程，且认真细致，灵活快捷，受到医务人员、病人家属的好评，初露锋芒。他很少回乡，一心扑在医学事业上。同年12月毕业，他回家探亲，村里父老听说他是个“大学生，医学大夫”，前往探访的人不少。村里患病多年不愈的黄荣金和织舟黎氏夫人，经他诊治一周以后，就痊愈没有复发。消息传开，远近乡亲都前来探访、求诊。邻近江美坪田心的陈秀娣被枪误打，子弹藏在“裤带部”体内，经常隐痛难受，不能劳动，变成半残废。她得知世德回家，医术又很高明，就前来求诊。经他诊断并用随身携带回来的医疗器械，为她做了手术，把藏在体内的子弹头取了出来，很快恢复了健康。这样一传十，十传百，上门就诊的人川流不息，家庭成了诊室，治 愈的病人越来越多。
1915年3月，他得到马丁院长的极力推荐，被保送到德国柏林大学医学系深造。在5年多的留学深造中，他怀着振兴祖国医学的雄心，顽强拼搏，刻苦攻读，成为医学系里首屈一指的优才生，荣获了德国柏林大学医学博士的学位，为祖国赢得了荣誉。
1919年9月，他学成归国后，受聘于韬美医院（今广州医学院第一附属医院）当主治医师，后晋升为外科医务主任，矢志为祖国贡献自己的才能。1921年底，民主革命的先行者孙中山先生正准备誓师北伐时，陈炯明突然叛变。随后革命军组织东征医疗队，黄世德毅然参加，被编入国民革命军第四军军属军医处，开展战地医疗工作。在革命军东征、北伐的战斗中，他发挥自己的医学专长、高超的手术才能，抢救过无数的士兵和将领，立了战功，因而由中尉军医官很快晋升为少校军医主任、中校军医处长。
在战事频繁的岁月中，他骑着一匹战马昼夜不停地来回赶赴各处伤员驻地，抢救危急伤病官兵，从不歇息。后来这匹战马终因劳累过度，不幸染病而死，给抢救工作带来困难。在座骑不能及时配给的情况下，黄军医出于救死扶伤的人道主义，坚持徒步行军，尽职尽责，出色地完成任务。由于风餐露宿，生活条件极其艰苦，致使黄军医积劳成疾，病倒在行军途中。后经批准送粤治疗。病愈后，北伐军已越武汉，渡过了长江。为了更好地支持北伐军医务的需要，他与同窗好友陈汝棠、黄宝坚、何可、何棣华、倪肇荣等人，协力创办一所广东省调剂救护学校。他还兼任教官，为北伐军培养医护人员不遗余力。
与此同时，他继续在韬美医院当主治医师、外科主任。同时自己还在广州市仁济路开设一间“唯一医务所”，对来诊病人免收诊金，困难的还可赠药。为了提高医疗质量，他不断总结实践经验，每次诊病手术后，都把病例逐一登记储好，定期约请广州市名医何可、何棣华等悉心研究，认真分析，以达到精益求精的境界。他还著书立说，他还有很多膏丹丸散的制作著述，单类处方、专治皮肤病的特效药方等，可惜这些著述在50年代初已全部遗失。
正当黄世德医术名噪于世之时，北伐军有一将领（忘记其名）腿部负重伤，送回粤治疗，经众多中西医生诊治，都认为非截肢不可，但经黄博士细心检查过后，断定可不用截肢，只需手术就可治愈。他对该将领的手术做得很好，使其很快恢复了健康。事后该将领为了答谢黄博士的功绩，摆酒庆功，把过去医治过他的中、西医生都请来祝贺，席间人们频频向黄博士敬酒贺喜。
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黄世德是个忠厚诚实的人，在此热烈气氛中，尽情欢饮，想不到饮酒过量而中毒。当他回到唯一医务所时就感到身体不舒服，喉头开始嘶哑不能讲话，紧接着昏迷不醒，后经多方抢救医治无效而逝，享年仅36岁。
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