1931年参加工农红军，同年加入中国共主义青年团，1934年转入中国共产党。第二次国内革命战争时期，任红二十三军政治部宣传队宣传员，“信康赣游击大队”班长、分队长、中队长、大队政治指导员。参加了中央苏区三至五次反“围剿”战斗。
1934年10月中央主力红军长征后，奉命留在南方坚持游击战争，任湘粤赣边游击支队第四大队副政治委员、第七大队政治委员。在艰难困苦的斗争环境中，曾昭墟率领所部同敌军周旋在大山里，英勇奋战，多次粉碎国民党军的“清剿”，旗帜鲜明地和叛徒作坚决斗争，为巩固和发展游击根据地作出了重要贡献。抗日战争时期，任新四军第一支队二团连政治指导员，先遣支队政治处组织股股长，第二支队新三团参谋长，新四军特务团营政治教导员，第七师干部队队长。“皖南事变”中，他负责收容失散人员，组织突围，胜利到达皖中新四军第七师驻地。
1941年曾昭墟奉命调苏北新四军军部工作，途经南京附近的八卦洲时被汪伪查捕，关押在南京的感化院整整一年。狱中，他参与建立临时党支部，团结同志，同敌人作坚决斗争。同时，设法同狱外党组织取得联系，将组织送来的经费，分给出狱的同志作路费，教育他们归队。经组织营救出狱后，曾昭墟回到新四军十八旅五十二团任营长、营政治教导员，第一师教导旅政治部组织科科长，教导旅第一团政治处主任，新四军第一纵队一旅二团参谋长。解放战争时期，任华东野战军第一纵队一师二团团长、第三师参谋长，第三野战军二十军六十师参谋长，参加了宿化、鲁南、莱鞠、孟良崮、豫东、淮海、渡江、上海等战役战斗。解放一江山岛时，在登陆突击第一梯队攻占一江山岛各主要高地后，曾昭墟迅即指挥第二梯队投入歼灭国民党守军最后一批支撑点的战斗。指战员们发动政治攻势，边打边喊话，有的还利用俘虏军官喊话。残存的守军见大势已去，纷纷缴械投降。
1955年1月18日17时55分，曾昭墟按浙东前指命令，指挥登陆部队清理战场，转入防御。国民党军苦心经营的所谓“美国造、击不沉的战舰”“攻不破的钢铁堡垒”，被我三军干脆利落地攻占了。曾昭墟在解放一江山岛战役中又一次显示了卓越的军事指挥才华，升任为20军副军长。20军驻扎中原，抓备战，抓训练，枕戈待旦，丝毫不敢松懈。1964年“八一”建军节前夕，曾昭墟一身戎装，顶着烈日，步履骄健地来到湖州山野训练场，视察和指导战士们的赛前训练。他看到几个兴国藉战士生龙活虎，取得优秀成绩，兴奋地说：董必武副主席曾给兴国题词：‘兴国男儿无敌手，井冈旗帜有文章’，你们是兴国男儿，要苦练杀敌。新中国成立后，奉命赴朝作战，任中国人民志愿军副师长，在朝鲜参加了第二次、第五次战役和华川阻击战。回国后任六十师师长，参加组织指挥解放一江山岛等浙江沿海岛屿的战斗。
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1973年3月5日在杭州含冤去世，享年57岁。
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